Kereta bandara Yogyakarta diundur operasional nya pada bulan September 2021 karena pandemi. Jenderal Perkeretaapian Zulfikri mengatakan waktu beroperasinya kereta bandara masih terus menunggu arahan dari Menteri Perhubungan meski sarana dan prasarana telah selesai.
Untuk peresmian nanti akan dilakukan secara bertahap melihat perkembangan situasi dan kondisi saat ini pengunduran ini juga disebabkan karena sampai saat ini wilayah Yogyakarta juga masih menerapkan PPKM.
Direncanakan kereta bandara tersebut baru beroperasi pada September mendatang