Pengamat Pendidikan Islam, M Najih Arromadloni menilai ada pihak yang bermain-main dalam kasus Ponpes Al Zaytun. Hal ini karena dibiarkan dalam waktu lama.
Ponpes Al Zaytun terus menjadi perbincangan hangat karena menuai banyak kontroversi. Mulai dari ajaran Islam yang menyimpang hingga keterkaitan dengan NII KW9.